海洋工程在环保方面有着广泛的应用。其中，海上风电可以替代传统的火力发电，降低温室气体的排放。海水淡化厂可以利用海水制取淡水，缓解用水压力。海洋垃圾处理设施则可以将污染的海洋垃圾进行收集、分类、处理，降低海洋污染程度。此外，海洋生物开发、海域规划、海洋环境监测等都可以借助海洋工程实现环境保护的目的。
在应用海洋工程时，要注重生态环境保护、资源利用和环境风险防范等问题。对于海洋生态环境的影响，应采取相应的防范和监测措施，减少对生态环境的负面影响。对于资源利用和环境风险方面，要严格控制开采的规模和方式，减少对自然环境的破坏和污染风险。
