合同协议可以涉及商业机密，但是在签订合同协议前需要非常小心谨慎。如果商业机密被曝光或泄漏，可能会导致公司经济损失甚至破产。因此，公司需要非常谨慎考虑哪些商业机密可以被揭露以及如何强制执行保密条款。
在签订合同协议时，公司需要确保涉及商业机密的条款得到充分保护。一种常见的保护方式是打包商业机密在一份附加协议中，并要求合同另一方签署保密协议。此外，公司还可以要求对商业机密进行加密或者通过其他方式保证安全的存储、传输和处理。
总之，合同协议可以涉及商业机密，但是在签署合同之前需要对保密协议进行充分阐释，以确保双方的权益得到保护。
