崇明东滩湿地公园的管理模式主要采用“政府主导、企业运营、社会参与”的模式，即由政府主导，企业运营和社会各界积极参与的方式来管理。
首先，政府主导，成立了管理机构——上海崇明东滩湿地公园管理有限公司，负责崇明东滩湿地公园的规划、建设和日常管理。
其次，企业运营，上海崇明东滩湿地公园管理有限公司负责景区的运营管理和旅游开发，将崇明东滩湿地公园打造成为集生态观光、科普教育、文化艺术、运动健身和休闲娱乐于一体的现代绿色生态旅游胜地。
最后，社会参与，崇明东滩湿地公园鼓励社会各界积极参与公园的规划、建设和保护工作，在推进公园可持续发展的同时，也加强了社会与公园的互动交流，实现了人与自然的和谐发展。
