《怪物猎人ポータブル3rd》共有16张地图，其中包括5张大型地图。这5张大型地图分别是石之州、闪映之海、沙原、竹老林和火山地底洞。这些地图都由多个区域组成，玩家需要在地图中与各种怪物作战并收集材料。
石之州是一个有着许多洞穴和拥有石林的地方。闪映之海是一个大海，有着很多沙滩和珊瑚礁，其中生存着几种鱼和水母。沙原则是一个沙漠地形，有着大量的沙丘和岩石，这里生活着翼龙等飞行动物。竹老林则是一个由竹林和河流构成的地方，这里有着大量的草药和昆虫。火山地底洞是一个火山洞穴，有着多个区域，其中包括一个有着熔岩和火山气息的区域。
