根据京东相关规定，如果您已经向京东支付了预付款的定金，但由于种种原因需要取消订单并申请退款的话，您是可以申请退还已支付的预付款定金的。不过需要注意的是，退款金额将扣除相应的费用，并且以上规则只适用于符合退款条件的情况。
具体来说，如果您在支付定金后取消订单造成商家的经济损失，那么相应地会收取一定的违约金或者赔偿金。这些手续费将直接从您的订单支付金额中扣减，因此实际退款金额会比您支付的定金金额要少。
所以，如果您需要申请退款，请先了解清楚京东的退款政策及相关的手续费用，以便在操作过程中做好记录并保留好相关凭证。
