农业部种植业管理司本部设在北京，并设立了五个直属机构：农业科研创新中心、作物加工推广中心、绿色优质高产作物服务中心、种业信息化中心和作物栽培技术服务中心。其中，农业科研创新中心负责种业科技创新、育种、试验、评价等方面工作；作物加工推广中心负责推广粮油作物、绿色蔬菜等农产品的优良品种和先进技术；绿色优质高产作物服务中心负责推广绿色优质高产农作物新品种和新技术、开展绿色优质高产农产品保护和建设工作；种业信息化中心负责推进农业信息化工作，开发种业信息化软件、制定标准和规范并建设种业信息化平台；作物栽培技术服务中心负责研究和开发作物栽培新技术、新方法，向广大种植业生产者提供作物栽培技术指导。
